Question perspicace : en fait tout dépend de l'architecture de l'avion et des technologies embarquées.
La logique voudrait que l'on mette les dispositifs de refroidissement au plus près du moteur. Dans le cas du Mustang, il s'agit d'un refroidissement liquide (d'où le radiateur). Et dans de tels cas, le dispositif de refroidissement est sous le fuselage car il a besoin de beaucoup refroidir (c'est mal dit mais bon ) : il n'y a qu'à voir la taille du zinzin. Et cet emplacement représente le meilleur compromis traînée/efficacité.
EDIT : j'ai aussi trouvé cette information :
Ce qui signifie qu'en plus des raisons citées ci-dessus, il s'est avéré que ce type de prise d'air faisait sortir l'air chaud du radiateur + vite qu'il n'y rentrait, créant ainsi comme une poussée supplémentaire. Mais ça a été découvert "après coup", lors d'essais en soufflerie.